Genoma biltegiratzeko erronkak: nora joango dira milioika datu genomiko?

• Egilea:
• Egilearen izena

  Quantumrun Prospektiba
• Apirilaren 24, 2023

Genomikaren industriak arrakasta handia izan du, eta horren ondorioz, DNA sekuentziatzeko datu kopuru handiak sortu dira. Datu hauek zaila izan daitezke zientzialariek aztertzeko eta guztiz erabiltzeko tresna nahikorik ez dutelako. Hodeiko informatikak arazo hau konpon lezake zientzialariei datuak urrutitik sartu eta prozesatzeko aukera emanez Internet bidez.

Genomaren biltegiratzeak testuingurua zalantzan jartzen du

Genomikaren erabilera sendagaien garapenean eta osasun-laguntza pertsonalizatuan nabarmen handitu da DNAren sekuentziazioaren kostuaren jaitsieraren ondorioz. Lehenengo genoma sekuentziatuak 13 urte behar izan zituen eta 2.6 milioi dolar inguruko kostua izan zuen, baina 2021ean posible da pertsona baten genoma egun baten azpian sekuentziatua izatea 960 dolar dolar baino gutxiagoren truke. Aurreikuspenen arabera, 100erako 2025 milioi genoma baino gehiago sekuentziatuko dira hainbat proiektu genomikoren barruan. Farmazia-enpresek zein populazio-genomikako nazio-ekimenek hazten jarraitzea espero duten datu kopuru handiak biltzen ari dira. Azterketa eta interpretazio egokiarekin, datu hauek doitasun medikuntzaren eremuan nabarmen aurrera egiteko ahalmena dute.

Giza genomaren sekuentzia batek 200 gigabyte inguru datu gordina sortzen ditu. Bizitza zientzien industriak 100erako 2025 milioi genoma sekuentziatzea lortzen badu, munduak 20 milioi gigabyte baino gehiago datu gordina bilduko ditu. Datuen konpresioaren teknologien bidez datu kopuru handi hori partzialki kudeatzea posible da. Erresuma Batuan kokatutako Petagene bezalako enpresak datu genomikoen tamaina eta biltegiratze kostuak murrizten espezializatuta daude. Hodeiko soluzioek biltegiratze-arazoei aurre egin eta komunikazio- eta erreprodukzio-gaitasunak hobetu ditzakete. 

Hala ere, farmazia-enpresa handiek datuen segurtasunarekin arriskuak hartzea saihesten dute eta biltegiratzeko eta aztertzeko barne azpiegiturak nahiago dituzte. Datuen federazioa bezalako teknikak txertatzeak arrisku hori murrizten du, sare ezberdinetako ordenagailuek elkarrekin lan egiteko aukera ematen baitu datuak modu seguruan aztertzeko. Nebula Genomics bezalako enpresek gehiago sartzen ari dira genoma osoko sekuentziazioa blockchain-en oinarritutako plataforma batean jartzeko, erabiltzaileek beren datuak norekin partekatzen diren kontrolatzeko eta erakundeak desidentifikatzeko datuetara sartzeko, osasunaren joerak ulertzeko.

Eragin disruptiboa 

Datu genomikoen biltegiratze-erronkek, ziurrenik, askoz enpresa gehiago bultzatuko dituzte hodeiko konputazioko soluzioetara pasatzera, IT azpiegituretan kostu handiak ordaintzea saihesteko. Biltegiratze-hornitzaile gehiago lehiatzen diren heinean beren soluzioak industrian nabarmentzeko lehian, zerbitzu horiekin lotutako kostuak gutxituko dira ziurrenik, eta 2030eko hamarkadan genomaren berariazko teknologia berria sortuko da. Hasiera batean enpresa handiek zalantzak izango dituzten arren, ziurrenik hodeiko informatika-teknika seguruagoen onurak ikusiko dituzte eta haiek erabiltzen hasiko dira. 

Balizko beste irtenbide batzuk izan daitezke data lakes, informazio egituratu eta egituratu gabeko guztia edozein eskalatan gordetzeko aukera ematen duen biltegi zentral bat. Datuen biltegiratzea, iturri anitzetako informazioa sistema bakar eta integratu batean zentralizatzea dakarrena, datu genomiko kopuru handiak gordetzeko eta kudeatzeko metodo bideragarria ere izan daiteke. Datuak kudeatzeko sistema espezializatuek funtzio aurreratuak eskaintzen dituzte, hala nola segurtasuna, gobernantza eta integrazioa. Zenbait kasutan, beharrezkoa izan daiteke datu genomikoak lokalean gordetzea etxeko zerbitzarietan. Aukera hau egokia izan daiteke eskala txikiko proiektuetarako edo datuen segurtasun-baldintza zehatzak dituzten erakundeetarako.

Blockchain-en oinarritutako irtenbideak ere asko erabiliko direla espero daiteke. Teknologia hau erabiltzearen abantaila nagusietako bat gizabanakoek beren datu genomikoen jabetza mantentzen dutela da. Ezaugarri hau garrantzitsua da informazio hori oso sentikorra delako, eta norbanakoek kontrolatu beharko lukete nola erabiltzen eta partekatzen den.

Genoma biltegiratzeko erronken inplikazioak

Genomaren biltegiratze-erronkeen inplikazio zabalagoak honako hauek izan daitezke:

• Ziberkriminalentzako aukera berriak, genoma biltegiratzeko sistemak behar bezain seguru egiten ez badira.
• Presioa gobernuei datu genomikoen erabilerari eta babesari buruzko politika sendoagoak ezartzeko, bereziki baimena lortzea.
• Arrakasta bizkortu da droga- eta terapia-garapenetan, datu-base genomiko masiboen analisiaren inguruko erronka teknikoak konpondu ondoren.
• Gero eta gehiago dira datu genomikoetarako eta ikerketa zientifikoetarako produktu eta zerbitzu espezializatuak sortzen dituzten hodeiko zerbitzu-hornitzaileak.
• Blockchain-en oinarritutako datuak biltegiratzeko eta kudeatzeko sistemak erabiltzen irakasten ari diren zientzialari eta ikerlariei.

Kontuan hartu beharreko galderak

• Nola uste duzu erabili daitezkeela gizabanakoei buruzko datu genomikoak?
• Nola aldatuko dela uste duzu datu genomikoen biltegiratzea eta kudeaketa, eta zer eragin izango du horrek osasunean eta ikerketan?