Mewn perthynas â'r logisteg sy'n ymwneud â hydrogen gwyrdd yn arbennig, bydd angen rhoi sylw i leoliad cyfleusterau cynhyrchu. Yn aml, mae’r rhain yn cael eu clustnodi ar gyfer ardaloedd lle mae ffynonellau ynni adnewyddadwy yn doreithiog—fel Awstralia, Gogledd Affrica a’r Dwyrain Canol—ond filltiroedd lawer i ffwrdd o’r man lle bydd yr hydrogen yn cael ei ddefnyddio mewn gwirionedd.